መቼ ነው ግብረ-ሰዶማዊነት የምንጠቀመው?

2024 ደራሲ ደራሲ: Elizabeth Oswald | [email protected]. ለመጨረሻ ጊዜ የተሻሻለው: 2024-01-13 00:03

የሆሞሎጂ ሞዴሎች እንዲሁ በመዋቅራዊ ባልሆኑ ተዛማጅ ፕሮቲኖች መካከል ያሉ ጥቃቅን ልዩነቶችን ለመለየት መጠቀም ይቻላል። ለምሳሌ፣ ዘዴው በNa⁺/K^{+ ATPase እና ስለተለያዩ የATPases ትስስር መላምቶችን ለማቅረብ ዘዴው ጥቅም ላይ ውሏል።.}

የሆሞሎጂ ሞዴሎች ለምን ጥቅም ላይ ይውላሉ?

ሆሞሎጂ ሞዴሊንግ የፕሮቲን 3D አወቃቀሩን ከአሚኖ አሲድ ቅደም ተከተል ለማወቅ ከሚጠቀሙት የስሌት መዋቅር ትንበያ ዘዴዎች አንዱ ነው። የስሌት መዋቅር ትንበያ ዘዴዎች በጣም ትክክለኛ እንደሆነ ተደርጎ ይቆጠራል. ቀላል እና ለመተግበር ቀላል የሆኑ በርካታ ደረጃዎችን ያካትታል።

ሆሞሎጂ ሞዴሊንግ ምንድን ነው እና ለምን ያስፈልጋል?

ሆሞሎጂ ሞዴሊንግ የታላሚ ፕሮቲን ባለ ሶስት አቅጣጫዊ መዋቅር በአብነት እና በዒላማ ቅደም ተከተሎች መካከል ባለው ተመሳሳይነት ላይ በመመስረትያገኛል እና ይህ ዘዴ የሜምብል ፕሮቲኖችን በማጥናት ረገድ ውጤታማ መሆኑን ያረጋግጣል። የ… ከፍተኛ ግንዛቤን ስለሚሰጥ እንደ GPCR ለመምሰል ከባድ ናቸው።

የሆሞሎጂ ሞዴል እንዴት ነው የሚሰሩት?

በሆሞሎጂ ሞዴሊንግ ውስጥ በርካታ ደረጃዎች አሉ።

የእርስዎን ኢላማ ቅደም ተከተል በመጠቀም የአብነት ምርጫ። ለዚህ ዓላማ በሁሉም የሚገኙ የፕሮቲን አወቃቀሮች (PDBs) ላይ BLASTp ፍለጋ ማድረግ ይችላሉ። …
የአብነት እና የዒላማ ቅደም ተከተል አሰላለፍ። …
የእርስዎ ሞዴል ጥራት። …
ማጣራት።በዚህ መሰረት የእርስዎ ሞዴል።

ጥሩ ሆሞሎጂ ሞዴሊንግ ምን ያደርጋል?

"ከፍተኛ የተሳካ የሆሞሎጂ ሞዴል" <=2 Å rmsd ከተጨባጭ መዋቅር እንዳለው ከገለፅን አብነቱ ለስኬት ከታቀደው >=60% ተከታታይ መለያ ሊኖረው ይገባል። ተመን >70%። በከፍተኛ ተከታታይ ማንነቶች (60%-95%) እንኳን ከአሥሩ የሆሞሎጂ ሞዴሎች መካከል አንዱ msd >5 Å ከ ጋር አለው።